試験時間は90分ですが、時間的に余裕があるものでしょうか

受験者のレベルによりますが、余裕はないと思います。

特にシミュレーション問題に時間がかかります。

管理人が受検した時は、シミュレーション問題が2問出題されました。
1問あたり、15分～20分ほどかかりましたので、シミュレーション問題だけで、約30分かかります。

CCNAの問題は全部で50～60問ありますので、シミュレーション問題を除いた48～58問を60分で解くことになります。
1問あたり、約1分ですね。

管理人は、10分前に終了したのでほぼ時間を使い切った状況です。